GenómicaSAICLART® v1.1

SAICLART® es el software de procesamiento de imagen para el análisis e interpretación de microarrays de GENOMICA. Originariamente desarrollado para su plataforma de diagnóstico, actualmente es capaz de procesar todo tipo de microarrays spoteados en portas, pocillos o microplacas.


El análisis de imagen se realiza de forma completamente automatizada, evitando cualquier subjetividad que pudiera introducir la participación del usuario. Los resultados se obtienen de forma rápida, precisa y reproducible. Su arquitectura le proporciona una gran capacidad de adaptación a todo tipo de laboratorios tanto de I+D como de diagnóstico in vitro.


Gracias a sus avanzados algoritmos de visión artificial, SAICLART® distingue los spots de cualquier otra señal registrada en la imagen del microarray:


  • Los spots pueden validarse de acuerdo a criterios morfológicos.
  • Su señal se cuantifica considerando toda su área efectiva, midiéndose hasta 30 variables por spot como su posición, área, forma, homogeneidad, etc.
  • Dichos algoritmos permiten descartar artefactos, fibras, burbujas y otras partículas ajenas a la técnica, reduciendo el número de falsos positivos y negativos
  • Además, resuelven defectos en los spots como donuts, cometas, desviaciones de posición, etc.

SAICLART® proporciona al usuario:


  • Resultados rápidos y reproducibles
  • Múltiples métodos de normalización y corrección del fondo
  • Acepta layouts de cualquier dimensión, con una o más gradillas, una o más muestras por imagen, etc.
  • Alineamiento de la cuadrícula avanzado, capaz de procesar microarrays imprimidos en pocillos individuales en cualquier ángulo de rotación

SAICLART® puede adaptarse a cualquier plataforma basada en microarrays, integrarse con otro software, y trabajar con otros scanners.


  • Está disponible como DLLs enlazables desde código escrito en C++, C++/CLI, C#, VB.NET y python
  • Presenta un API muy sencillo de utilizar
  • Soporta gran variedad de formatos de imagen como bitmaps de Windows, JPEG, PNG, TIFF, etc.
  • Abarca una profundidad de imagen de entre 8 y 16 bits.
  • Produce los resultados en formato XML
  • Requiere Windows XP SP2 y al menos 256 Mb de RAM

 

                                                                                                                    


 

 

 

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